（一）境域

1996年，云霄县政区总面积1166平方公里。经实测和重新划界，至2006年，云霄县政区总面积为1157.452平方公里。其中，陆域面积1050.75275平方公里（采用2009年12月31日全国二次土地调查数据，县国土资源局提供）。海域面积106.7平方公里（县海洋与渔业局提供，经2003、2004年实测计算，下同），由漳江湾、东山湾（部分）、八尺门水道等组成。海岸线长度为75.5公里。自漳江南北水闸处起算，沿东厦、列屿、陈岱，止于八尺门云霄-诏安两县海域界线。陆域境域四至除公路界牌外，东以梁山山脉的梁山、鸡笼石山与漳浦县为界；东南至八尺门海堤中心点与东山县为界；南以竹港村墓山、半径自然村剪刀岭尖和乌山山脉的乌山、西山源与诏安县为界；北以背虎山、白石岽山、笔架山、大帽山与平和县为界。东西最大距离31公里，南北最大距离38公里。

1998年10月，云霄境属常山华侨农场由省侨办正式移交漳州市人民政府直接管理，成立漳州市常山华侨经济开发区，行政建制直属于漳州市辖，但其区域尚未获国家区划相关部门批准而升格为县级行政区划，故至2006年底云霄县境域版图未变。

（二）乡镇区划

1996年，云霄县境划分为云陵、莆美、东厦、陈岱、峛屿、火田等6个镇，下河、马铺、和平等3个乡和国营和平农场（与和平乡同一套领导班子）、常山华侨农场（隶属于福建省侨务办公室）、国营圆岭林场（在火田镇境内，隶属于漳州市林业局管理）、顶溪水稻原种场（在莆美镇境内）。

1998年10月，境属常山华侨农场加挂常山华侨经济开发区牌子，划归漳州市直接管理，赋予一定的行政管理权。2006年7月，从莆美镇划出上坑、马山、益宝山、树洞、大埔、下径、三东、狮山等8个行政村，归云陵工业开发区（同乡镇一级）管理。

2024年，全县乡镇区划为云陵镇、陈岱镇、东厦镇、莆美镇、火田镇（含圆岭林场）、峛屿镇（2006年后改称列屿镇）、下河乡、马铺乡、和平乡、云霄经济开发区。

（三）村、社区、作业区与自然村落

1996年，全县划分为162个行政村、10个街道和36个管理区、作业区、工区（含常山、圆岭林场）。之后，全县村、街道、管理区（常山华侨农场）、作业区（和平农场）、工区（圆岭林场）的划分，随着农村人口进入县城、城区的扩大而变动。1999年，由于工人外迁，和平乡撤销田仔苏、龙透2个作业区。田仔苏作业区土地由宜谷径作业区代管。龙透作业区土地由本地工人代耕代管。2000年8月，云陵镇增设北园社区、金霞社区，莆美镇增设宝洋、绥东社区。同年11月，云陵镇增设城元社区，莆美镇增设宝城社区。2002年12月，县政府根据上级精神，撤销云陵、莆美15个居委会建制，全部改设为社区居民委员会。翌年，全部完成社区居委会改选。至2024年，全县共划分为197个村（居）、39个社区、158个建制村。　　

注：以上含乡、镇、村、社区、作业区及自然村落等地名。